㈠ 如何用VASP計算H原子的振動頻率
如何用VASP計算H原子的振動頻率
這些天做了些測試，嘗試找了一些結構，但是不知道是否穩定，因此打算算一下聲子譜。
VASP不能完整地算聲子譜，只能求gamma點的。完整地計算要用phonopy。
INCAR文件如下：
SYSTEM = Si
PREC = Accurate
ENCUT = 245
ISART = 0
ISMEAR = -5
IALGO = 48
NSW = 60
IBRION = 5
NFREE = 2
EDIFF = 1E-5
POTIM = 0.0005
其中要注意，k點數目小於4個時，這種情況下對布里淵區積分不能用四面體方法(也就是INCAR里的ISMEAR=-5),加密K點或改成ISMEAR=0應該就可以了。
㈡ 聲子譜模擬計算軟體關於聲子譜計算，有哪些常用的軟體
聲子譜一般常用vasp,目前國內也開發了PWmat軟體也可以用於聲子譜計算，計算速度更快。
㈢ 求教針對VASP分子動力學計算的數據結果分析問題
1. 如何提取溫度-時間和總能-時間變化信息？
溫度，能量-時間信息在OSZICAR裡面，可以用grep提取。
2. 一般有哪幾種方式可以得到徑向分布函數RDF分布曲線？
不懂什麼意思，RDF曲線按公式算就行。好像有中子衍射數據的話可以做Fourier變換從試驗上得到，這塊不太懂。
3. VMD讀取vasprun.xml得到RDF的具體操作步驟是什麼？尤其是不懂selection1、selection2如何選取？
數據導入到vmd後，點extension->radio distribution funcion->Use Molecule選你需要的molecue,一般直接把xml文件拖進去的話這個只有一個，選了就行。
selection 1 和 selection 2分別是中心原子（類）和相對原子（類）。
這里要用vmd的選擇原子的語言，比如，我算vasp時候INCAR裡面是Li和O，那麼vasp.xml導入vmd以後就會有type Li和type O。這里type是關鍵字。
以我的為例子，我selection 1 裡面寫type Li，selection 2裡面也寫type Li。那我得到的就是Li的g（r）。
你的體系要自己看了。如果對特定分子有要求，就要自己對原子進行重新定義。
㈣ 怎麼用VASP計算聲子譜
劉仕晨(站內聯系TA)vasp是不能直接計算聲子譜的，至少我弊薯不知道啦， 我們經費不多，所以是用免費的phonopy介面vasp計算的，當然也還在摸索中大卜磨，不知道其他大神有沒有好的方法，或者用pwscf計算聲子劉仕晨(站內聯系TA)集群裝phonopy可能有點麻煩了，因為裝之前要裝很多東西，不過phonopy不需要太大的資源，如果你對裝這個不是很在行的話，可以用台式機或者筆記本裝一個ubuntu的linux系統滾斗，按照官網的提示一步步操作就可以了，如果你很在行安裝這些軟體的話，可以去下載那些之前的准備軟體，都安裝了，然後再安裝phonopyidentation(站內聯系TA)裝phonopy，這個很麻煩，好像需要root許可權的。 裝好phonopy之後，你參照phonopy的網站即可，有兩種模式，一種是有限差分，一種是線性響應，你google搜索phonopy，之後到phonopy網站，找VASP+phonopy，然後按說明做即可！ 如果只算gamma點的，vasp中把IBRION改成6或者8就行，你搜一下IBRION這個選項future_wl(站內聯系TA)我們用vasp+phonon算的，不過phonon是收費的。。。。。。
㈤ VASP 簡介
VASP全稱Vienna Ab-initio Simulation Package，是維也納大學Hafner小組開發的陵蠢祥進行尺搏電子結構計算和量子力學-分子動力學模擬軟體包。它是目前材料模擬和計算物質科學研究中最流行的商用軟體之一。
主要功能：
1、採用周期性邊界條件(或超原胞模型)處理原子、分子、團簇、納米線(或管)、薄膜、晶體、准晶和無定性材料，以及表面體系和固體檔敬
2、計算材料的結構參數(鍵長,鍵角,晶格常數，原子位置等)和構型
3、計算材料的狀態方程和力學性質(體彈性模量和彈性常數)
4、計算材料的電子結構(能級、電荷密度分布、能帶、電子態密度和ELF)
5、計算材料的光學性質
6、計算材料的磁學性質
7、計算材料的晶格動力學性質(聲子譜等)
8、表面體系的模擬(重構、表面態和STM模擬)
9、從頭分子動力學模擬
10、計算材料的激發態(GW准粒子修正)
常用網站：
VASP 官網
https://www.vasp.at/
VASP 手冊
https://cms.mpi.univie.ac.at/vasp/vasp/vasp.html
VASP 官網計算教程實例
https://cms.mpi.univie.ac.at/wiki/index.php/Category:Examples
其它教程：
大師兄科研網《Learn VASP The Hard Way》
https://www.bigbrosci.com/categories/LVASPTHW/
VASP入門到精通
https://jingyan..com/season/49126
此外，科學網和小木蟲上也有很多關於vasp的教程。